Face aux difficultés de l’État à assurer la couverture sanitaire des militaires, il a été créé en 1985 le FPM (décret n°85 950 du 12 sept.1985). A l’origine EPN, le FPM est devenu Société de Secours Mutuels (décret n°93 776 du 29 sept. 1993) et la gestion, entièrement confiée à ses membres.
Régi par la loi de 1898 relative aux associations, le FPM est depuis Juin 2009 soumis au règlement n°07/2009/CM/UEMOA portant réglementation de la mutualité sociale au sein de l’UEMOA. Ses Statuts et Règlement Intérieur, mis en conformité, ont été adoptés par l’Assemblée Générale Extraordinaire de Juin 2013.